Dědičné onemocnění způsobené delecí či nonsense mutací v genu pro ApoA-I; následkem toho je chybění HDL. Nemocní mají někdy kožní xantomy, je však zajímavé, že rozvoj předčasné aterosklerózy není výrazně akcentován. Mutace genu ApoA-I, vedoucí k strukturním změnám genového produktu, jsou obvykle doprovázeny významně sníženou koncentrací ApoA-I a HDL v krvi. Nejznámější je mutace ApoA-I Milano se 40% snížením ApoA-I a 67% poklesem koncentrace HDL pro urychlený katabolismus ApoA-I. Tyto mutace jsou rovněž jen zřídka doprovázeny předčasnou aterosklerózou.