Jako aterogenní index (AI) se obvykle označuje výpočet odvozený z koncentrace celkového a HDL-cholesterolu, např. podle vzorce:
AI = (celkový cholesterol – HDL-cholesterol)/HDL-cholesterol
Čím vyšší je tento index, tím vyšší je riziko aterosklerózy. Aterogenní index slouží k eliminaci těch případů zvýšeného cholesterolu, které jsou způsobeny pouze zvýšením HDL a nejsou tedy rizikové. Jiný způsob výpočtu je výpočet podílu celkový cholesterol/HDL-cholesterol; měl by být nižší než 5, u vysoce rizikových osob dokonce pod 4. U osob s diabetem 2. typu, metabolickým syndromem a kombinovanou hyperlipidémií je navrhován aterogenní index, zohledňující kromě HDL-cholesterolu i triacylglyceroly: AI = log(triacylglyceroly/HDL-cholesterol).